En el Aeropuerto de Lima Jorge Chávez, los pasajeros que conectan entre dos vuelos internacionales en general pueden quedarse en la zona de tránsito sin pasar migraciones. Si conectas de un vuelo internacional a uno de cabotaje, entras al país aquí: pasas migraciones y retiras y vuelves a despachar el equipaje.
El aeropuerto tiene 3 terminales o sectores (Domestic gates (A), Gates C, International gates (D)).