En el Aeropuerto de Salzburgo, los pasajeros que conectan entre dos vuelos internacionales en general pueden quedarse en la zona de tránsito sin pasar migraciones.
El aeropuerto tiene 2 terminales o sectores (Terminal 1 (all scheduled flights), Terminal 2 Amadeus (ski charters)). No están conectados después del control de seguridad: para cambiar hay que volver a pasarlo.
Los pasajeros en conexión pasan un control de seguridad de tránsito.