En el Aeropuerto de Praga Václav Havel, los pasajeros que conectan entre dos vuelos internacionales en general pueden quedarse en la zona de tránsito sin pasar migraciones.
El aeropuerto tiene 2 terminales o sectores (Terminal 1 (non-Schengen, Piers A and B), Terminal 2 (Schengen, Piers C and D)).