En el Aeropuerto de Bogotá El Dorado, los pasajeros que conectan entre dos vuelos internacionales en general pueden quedarse en la zona de tránsito sin pasar migraciones. Si conectas de un vuelo internacional a uno de cabotaje, entras al país aquí: pasas migraciones y retiras y vuelves a despachar el equipaje.
El aeropuerto tiene 5 terminales o sectores (Terminal 1 - Muelle Internacional A, Terminal 1 - Muelle Internacional B, Terminal 1 - Muelle Nacional C, Terminal 1 - Muelle Nacional D, Terminal 2 (Puente Aéreo) - Muelle G).
Los pasajeros en conexión pasan un control de seguridad de tránsito.