El aeropuerto cuenta con operaciones comerciales regulares de Air Canada, Porter Airlines, WestJet, Flair Airlines (estacional), además de conexiones regionales a comunidades del norte a través de Bearskin Airlines, Wasaya Airways y North Star Air. En invierno se suman vuelos chárter vacacionales operados por Sunwing, Air Canada Vacations y WestJet Vacations.
La terminal de pasajeros abre sus puertas al público todos los días a las 3:00 am y permanece operativa hasta la llegada o salida del último vuelo programado de la noche, habitualmente sobre la 1:30 am.
La línea urbana Ruta 3 Memorial - Airport de Thunder Bay Transit conecta el aeropuerto con City Hall Terminal, Intercity Shopping Centre y Waterfront Terminal de 6:10 am a 0:20 am. Adicionalmente, operan vehículos de la aplicación URIDE y taxis autorizados (Roach's Yellow Taxi y Diamond Lacey's Taxi) en la acera frente a la terminal.
Tanto los lotes de corta estancia como los de larga estancia tienen una tarifa de $3.00 CAD por hora, con una tarifa máxima de $22.00 CAD por día. El sector de larga estadía dispone además de tomas eléctricas para calentadores de motor en invierno.
No, el Aeropuerto de Thunder Bay no dispone actualmente de salones VIP exclusivos ni salas afiliadas a redes de membresía como Priority Pass o aerolíneas. La sala de preembarque general ofrece asientos, tomas de corriente y servicios de cafetería.
Actualmente se construye el hotel Cambria de 107 habitaciones en el predio aeroportuario contiguo a la terminal. Mientras tanto, hoteles como Valhalla Inn, Hampton Inn & Suites y Best Western Crossroads se localizan a menos de 2 km a lo largo de Arthur Street, ofreciendo varios de ellos traslados coordinados.