Actualmente ninguna aerolínea comercial regular opera vuelos de itinerario hacia o desde el Aeropuerto Jorge Isaacs. Históricamente operaron compañías como SATENA, que canceló definitivamente sus servicios en esta terminal.
Vuelos chárter y corporativos
El aeródromo atiende vuelos privados y chárter orientados al traslado del personal y contratistas vinculados a la operación minera de Cerrejón:
- Helicol: Vuelos chárter y traslados corporativos hacia Barranquilla.
- Searca: Servicios aéreos chárter con destino a Barranquilla y Bogotá.